1. 奥米加兽X奥米加兽X是奥米加兽在X抗体加持下的进化形态，拥有特殊能力“全部删除”。在剧场版《第十三位皇家骑士》中，奥米加兽X利用这一技能格式化了世界树的数据，成为首位正面击败世界树的数码兽。2.

1. 奥米加兽X

奥米加兽X是奥米加兽在X抗体加持下的进化形态，拥有特殊能力“全部删除”。在剧场版《第十三位皇家骑士》中，奥米加兽X利用这一技能格式化了世界树的数据，成为首位正面击败世界树的数码兽。2. 暗黑巴古拉兽

作为《数码兽合体战争》上部的终极BOSS，暗黑巴古拉兽融合了暗黑骑士兽的力量，战力达到超究极体水准其麾下的巴古拉军（如七大将军、策略兽等）势力不亚于皇家骑士团在漫画中，暗黑巴古拉兽攻入世界树的老巢，甚至砍断世界树的枝干作为义肢，展现了与世界树平起平坐的实力。

3. 晶界兽

晶界兽是《数码兽合体战争》下部的BOSS，其个体战力足以对抗奥米加兽、帝皇龙甲兽等顶尖数码兽的联合攻击它能召唤大量怨毒吸血魔兽等军团，控制的领域覆盖现实世界镜像，势力范围与数码世界相当，因此也被认为有资格与世界树匹敌。

4. 巴古拉兽（普通形态）

在漫画《数码兽合体战争》中，巴古拉兽率领军队攻入世界树的领地，并利用世界树的枝干强化自身。尽管其力量部分源于世界树遗留的资源，但这一行为仍被视为对世界树的实质性挑战。5. 阿尔法兽（王龙剑形态）

阿尔法兽是世界树创造的实验体之一，但其最终反叛并试图消灭世界树。在《数码兽编年史》中，阿尔法兽与王龙剑合体后，若非奥米加兽X阻止，世界树可能已被其摧毁。6. 大门大（人类角色）

虽然并非数码兽，但第五部《数码兽拯救者》中，大门大凭借“唯心主义外挂”和集结的数码之魂，一拳击碎了世界树的防御，迫使世界树暂时放弃毁灭人类的计划这一战绩被部分粉丝视为对世界树的间接击败---补充说明- 争议角色：巴古拉兽和晶界兽的胜利依赖于世界树的遗留资源或特殊设定，而非纯粹实力压制；

- 其他潜在角色：如恒常性、数码死神等虽属“神级”存在，但通常被排除在数码兽范畴之外。